El balance histórico favorece al Baskonia: 5-2

La historia recoge duelos incandescentes entre el Unicaja y el Baskonia. Especialmente en los primeros años del siglo XXI se registraron muchos enfrentamientos. De 2001 a 2008 hubo seis encontronazos en los play off por el títulos, en todas las instancias (cuartos, semis y final). Antes, hubo otro choque, en 1998. Y la primacía es baskonista, con una ventaja de 5-2 en los precedentes.

 
La secuencia empezó con un 3-0 en cuartos de final de la 97/98 para el Baskonia. Después vino un chasco en la final de la tempotada 01/02. Con el factor cancha a favor, 0-3 arrasó el equipo de Dusko Ivanovic a Boza Maljkovic por entonces. Llegó la primera Victoria cajista en los cuartos de final en la temporada 2002/03, en la única vez que se ha disputado un quinto partido (3-2) entre los dos equipos.
Tras un año de receso, llegaron cuatro años seguidos de enfrentamiento en las eliminatorias por el título. Primero, una tremenda semifinal en la temporada 04/05 con 3-1 a favor de los baskonistas, con un mítico tercer partido ganado por el Unicaja en dos prórrogas. Ahí se quedaron todas las energías de los de Scariolo. En los máximos niveles de rivalidad, la final de 05/06, inolvidable para el Unicaja por esa victoria (3-0 en el total) en el Buesa Arena que permitió alzar el título de Liga.
Quedaban una eliminatoria de cuartos de final el año después (contundente 3-0 para los vascos con aquel lío de Rakocevic) y el último precedente, en la temporada 2007/08, con un 2-0 favorable al Baskonia después de aquellos tiros libres fallados inexplicablemente por Davor Kus en semifinales. Fue después de que el Unicaja, octavo, eliminara al Madrid de Joan Plaza, primero, en cuartos de final.