Éstos serán los 3 que queden fuera de la fase preliminar y los 16 perdedores de la primera ronda clasificatoria, cuyos nombres se confirmarán el 17/18 de julio.
Los encuentros de esta fase de la Liga Europa se jugarán el 26 de julio la ida y el 2 de agosto la vuelta.
- Ruta de los campeones de la segunda ronda de clasificación
Shkëndija (MKD)/The New Saints (WAL) - segundo clasificado de la ronda preliminar
Torpedo Kutaisi (GEO)/Sheriff (MDA) - HJK Helsinki (FIN)/Víkingur (FRO)
Spartak Trnava (SVK)/Zrinjski (BIH) - Kukës (ALB)/Valletta (MLT)
FC Santa Coloma (AND)/Drita (KOS) - Valur Reykjavík (ISL)/Rosenborg (NOR)
Astana (KAZ)/Sutjeska (MNE) - Alashkert (ARM)/Celtic (SCO)
F91 Dudelange (LUX)/Videoton (HUN) - primer clasificado de la ronda preliminar/Malmö (SUE)
Spartaks Jurmala (LVA)/Estrella Roja (SRB) - La Fiorita (SMR)/Lincoln Red Imps (GIB)
Suduva (LTU)/APOEL (CYP) - Flora Tallinn (EST)/Hapoel Beer-Sheva (ISR)
Olimpija Ljubljana (SVN)/Qaraba? (AZE) - Ludogorets Razgrad (BUL)/Crusaders (NIR)
Previamente la Liga Europa disputará su ronda preliminar, cuyos enfrentamientos se sortearon el pasado día 12:
Europa (GIB) - Prishtina (KOS)
Sant Julià (AND) - Gzira (MLT)
Engordany (AND) - Folgore (SMR)
B36 Tórshavn (FRO) - St Joseph's (GIB)
Birkirkara (MLT) - KÍ Klaksvík (FRO)
Tre Fiori (SMR) - Bala Town (WAL)
Cefn Druids (WAL) - Trakai (LTU)
Los partidos de ida se jugarán el 28 de junio, salvo el Sant Juliá-Gzira que será el día 26, y los de vuelta el 5 de julio.